MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782203

Total Repeats: 4426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014502	T	6	6	95	100	0 %	100 %	0 %	0 %	307149709
2	NC_014502	AGA	3	9	110	118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149709
3	NC_014502	CGT	2	6	175	180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149709
4	NC_014502	TCA	2	6	252	257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149709
5	NC_014502	AAC	2	6	309	314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149709
6	NC_014502	TGC	3	9	315	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149709
7	NC_014502	TTG	2	6	324	329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149709
8	NC_014502	CAA	2	6	337	342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149709
9	NC_014502	CACT	2	8	343	350	25 %	25 %	0 %	50 %	307149709
10	NC_014502	GAAG	2	8	355	362	50 %	0 %	50 %	0 %	307149709
11	NC_014502	TTG	2	6	371	376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149709
12	NC_014502	CCA	2	6	439	444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149709
13	NC_014502	TTG	2	6	498	503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149709
14	NC_014502	CAG	2	6	508	513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149709
15	NC_014502	CT	3	6	543	548	0 %	50 %	0 %	50 %	307149709
16	NC_014502	TAA	2	6	596	601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149709
17	NC_014502	CCA	2	6	631	636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149709
18	NC_014502	TTG	2	6	647	652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149709
19	NC_014502	TTC	2	6	734	739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149709
20	NC_014502	TGA	2	6	745	750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149709
21	NC_014502	GTA	2	6	801	806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149709
22	NC_014502	CTT	2	6	808	813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149709
23	NC_014502	GTTG	2	8	819	826	0 %	50 %	50 %	0 %	307149709
24	NC_014502	CATT	2	8	844	851	25 %	50 %	0 %	25 %	307149709
25	NC_014502	TGA	2	6	854	859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149709
26	NC_014502	TTG	2	6	890	895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149709
27	NC_014502	CCAGAG	2	12	907	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149709
28	NC_014502	TCG	2	6	976	981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149709
29	NC_014502	GGC	2	6	990	995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149709
30	NC_014502	TCG	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149709
31	NC_014502	TCT	2	6	1068	1073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149709
32	NC_014502	TTTAG	2	10	1134	1143	20 %	60 %	20 %	0 %	307149709
33	NC_014502	TCGA	2	8	1157	1164	25 %	25 %	25 %	25 %	307149709
34	NC_014502	G	6	6	1200	1205	0 %	0 %	100 %	0 %	307149709
35	NC_014502	GGA	2	6	1459	1464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149709
36	NC_014502	TTG	2	6	1476	1481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149709
37	NC_014502	TCA	2	6	1488	1493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149709
38	NC_014502	TCT	2	6	1501	1506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149709
39	NC_014502	AGG	2	6	1557	1562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149709
40	NC_014502	C	6	6	1588	1593	0 %	0 %	0 %	100 %	307149709
41	NC_014502	T	6	6	1605	1610	0 %	100 %	0 %	0 %	307149709
42	NC_014502	CCG	2	6	1623	1628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149709
43	NC_014502	TCG	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149709
44	NC_014502	GAG	2	6	1723	1728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149709
45	NC_014502	GATG	2	8	1778	1785	25 %	25 %	50 %	0 %	307149709
46	NC_014502	ATAAA	2	10	1803	1812	80 %	20 %	0 %	0 %	307149709
47	NC_014502	GTT	2	6	1979	1984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149710
48	NC_014502	GAGAA	2	10	2019	2028	60 %	0 %	40 %	0 %	307149710
49	NC_014502	A	8	8	2027	2034	100 %	0 %	0 %	0 %	307149710
50	NC_014502	T	7	7	2077	2083	0 %	100 %	0 %	0 %	307149710
51	NC_014502	AGA	2	6	2110	2115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149710
52	NC_014502	TCC	2	6	2176	2181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149710
53	NC_014502	A	6	6	2201	2206	100 %	0 %	0 %	0 %	307149710
54	NC_014502	GAA	2	6	2209	2214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149710
55	NC_014502	TCT	2	6	2275	2280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149710
56	NC_014502	T	6	6	2338	2343	0 %	100 %	0 %	0 %	307149710
57	NC_014502	TGA	2	6	2414	2419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149710
58	NC_014502	TTA	2	6	2453	2458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149710
59	NC_014502	ACA	2	6	2467	2472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149710
60	NC_014502	TGC	2	6	2541	2546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149710
61	NC_014502	CAT	2	6	2600	2605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149710
62	NC_014502	A	6	6	2607	2612	100 %	0 %	0 %	0 %	307149710
63	NC_014502	AT	3	6	2650	2655	50 %	50 %	0 %	0 %	307149710
64	NC_014502	GTTT	2	8	2670	2677	0 %	75 %	25 %	0 %	307149710
65	NC_014502	T	6	6	2741	2746	0 %	100 %	0 %	0 %	307149710
66	NC_014502	AG	3	6	2839	2844	50 %	0 %	50 %	0 %	307149710
67	NC_014502	T	6	6	2932	2937	0 %	100 %	0 %	0 %	307149710
68	NC_014502	TTGA	2	8	3084	3091	25 %	50 %	25 %	0 %	307149710
69	NC_014502	TCG	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149710
70	NC_014502	CGA	2	6	3326	3331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149711
71	NC_014502	AG	3	6	3514	3519	50 %	0 %	50 %	0 %	307149711
72	NC_014502	A	6	6	3534	3539	100 %	0 %	0 %	0 %	307149711
73	NC_014502	CAA	2	6	3584	3589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149711
74	NC_014502	TCTG	2	8	3967	3974	0 %	50 %	25 %	25 %	307149712
75	NC_014502	CAA	2	6	3999	4004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149712
76	NC_014502	CCG	2	6	4171	4176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149712
77	NC_014502	C	6	6	4190	4195	0 %	0 %	0 %	100 %	307149712
78	NC_014502	T	7	7	4216	4222	0 %	100 %	0 %	0 %	307149712
79	NC_014502	TGA	2	6	4247	4252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149712
80	NC_014502	AT	3	6	4352	4357	50 %	50 %	0 %	0 %	307149712
81	NC_014502	CTT	2	6	4373	4378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149712
82	NC_014502	GAA	2	6	4434	4439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149712
83	NC_014502	GAAA	2	8	4481	4488	75 %	0 %	25 %	0 %	307149712
84	NC_014502	GAA	2	6	4548	4553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149712
85	NC_014502	ATT	2	6	4556	4561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149712
86	NC_014502	TAC	2	6	4564	4569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149712
87	NC_014502	AAT	2	6	4604	4609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149712
88	NC_014502	GTA	2	6	4641	4646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149712
89	NC_014502	TGA	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149712
90	NC_014502	AAT	2	6	4689	4694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149712
91	NC_014502	GAA	2	6	4695	4700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149712
92	NC_014502	TGG	3	9	4757	4765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149712
93	NC_014502	T	6	6	4853	4858	0 %	100 %	0 %	0 %	307149712
94	NC_014502	TAA	2	6	4925	4930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149712
95	NC_014502	TGC	2	6	4943	4948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149712
96	NC_014502	CAA	2	6	4956	4961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149712
97	NC_014502	AAC	2	6	5017	5022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149712
98	NC_014502	T	6	6	5106	5111	0 %	100 %	0 %	0 %	307149712
99	NC_014502	ATG	3	9	5134	5142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149712
100	NC_014502	T	6	6	5202	5207	0 %	100 %	0 %	0 %	307149712
101	NC_014502	CGTT	2	8	5384	5391	0 %	50 %	25 %	25 %	307149712
102	NC_014502	GCT	2	6	5409	5414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149712
103	NC_014502	TTG	2	6	5479	5484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149712
104	NC_014502	ATA	2	6	5503	5508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149712
105	NC_014502	AAC	2	6	5523	5528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149712
106	NC_014502	GAT	2	6	5529	5534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149712
107	NC_014502	TTGGG	2	10	5548	5557	0 %	40 %	60 %	0 %	307149712
108	NC_014502	AAC	2	6	5641	5646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149712
109	NC_014502	TAA	2	6	5712	5717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149713
110	NC_014502	C	6	6	5815	5820	0 %	0 %	0 %	100 %	307149713
111	NC_014502	TCG	2	6	5903	5908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149713
112	NC_014502	CGG	2	6	5918	5923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149713
113	NC_014502	CTA	2	6	6079	6084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149713
114	NC_014502	A	6	6	6097	6102	100 %	0 %	0 %	0 %	307149713
115	NC_014502	TGTTGA	2	12	6107	6118	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307149713
116	NC_014502	ATA	2	6	6190	6195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149713
117	NC_014502	CCG	2	6	6205	6210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149713
118	NC_014502	AAT	2	6	6252	6257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149713
119	NC_014502	ATT	2	6	6288	6293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149713
120	NC_014502	GTT	2	6	6306	6311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149713
121	NC_014502	ATTA	2	8	6354	6361	50 %	50 %	0 %	0 %	307149713
122	NC_014502	AAAG	2	8	6402	6409	75 %	0 %	25 %	0 %	307149713
123	NC_014502	CTG	2	6	6454	6459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149713
124	NC_014502	GAA	3	9	6478	6486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149713
125	NC_014502	TTC	2	6	6524	6529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149713
126	NC_014502	TCC	2	6	6567	6572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149713
127	NC_014502	GTT	2	6	6670	6675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149713
128	NC_014502	GAG	2	6	6773	6778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149713
129	NC_014502	TAA	2	6	6779	6784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149713
130	NC_014502	A	6	6	6808	6813	100 %	0 %	0 %	0 %	307149713
131	NC_014502	CAG	2	6	6987	6992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149713
132	NC_014502	AATT	2	8	7007	7014	50 %	50 %	0 %	0 %	307149713
133	NC_014502	AAG	2	6	7037	7042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149713
134	NC_014502	GTTA	2	8	7062	7069	25 %	50 %	25 %	0 %	307149713
135	NC_014502	A	6	6	7074	7079	100 %	0 %	0 %	0 %	307149713
136	NC_014502	TCG	2	6	7152	7157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149713
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150	NC_014502	ATT	2	6	8002	8007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149713
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268	NC_014502	AAATTA	2	12	13493	13504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149717
269	NC_014502	TA	3	6	13539	13544	50 %	50 %	0 %	0 %	307149717
270	NC_014502	TTTTG	2	10	13548	13557	0 %	80 %	20 %	0 %	307149717
271	NC_014502	AAC	2	6	13563	13568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149717
272	NC_014502	TAT	2	6	13574	13579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149717
273	NC_014502	ATA	2	6	13605	13610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149717
274	NC_014502	ATA	2	6	13631	13636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149717
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281	NC_014502	A	6	6	16498	16503	100 %	0 %	0 %	0 %	307149719
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284	NC_014502	GGT	2	6	16589	16594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149719
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290	NC_014502	ATCC	2	8	17284	17291	25 %	25 %	0 %	50 %	307149720
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392	NC_014502	TTA	2	6	22887	22892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149723
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